今年9月6日，衛生部新發布的食品安全國家標準《速凍面米制品(征求意見稿)》 “生制品的微生物限量”中規定，每克生制品中檢出的金黃色注冊英國公司葡萄球菌含量只要在1000-10000個之間，都為合格。

11月17日，灣仔碼頭速凍水餃在南京被檢出含金黃色葡萄球菌。至此國內三大速凍食品品牌全部淪陷。這使得業界對于衛生部速凍食品新標準再次產生質疑。

這一規定與國標相左，也使得生產企業、檢驗機構無所適從。因為根據現行的《速凍預包裝面米食品衛生標準》(GB19295-2003)，金黃色注冊BVI公司葡萄球菌要求“不得檢出”。

11月11日，衛生部公布“速凍面米食品微生物指標問題”一文回應稱，金黃色葡萄球菌廣泛分布存在，對熱敏感，加熱80℃，30分鐘可被殺滅。另外，原來“不得檢出”的規定顯得不夠全面，無法反映微生物污染的真實情況和對人體的影響。

在《征求意見稿》中，衛生部采用了“國際微生物規格委員會”(ICMSF)三級采樣方案，用多個樣品定量檢測結果進行綜合判定，而該國際組織對金黃色葡萄球菌的限量標準為100-10000個。

南京市工商局并未明確指出灣仔碼注冊開曼公司頭產品的金黃色葡萄球菌含量，灣仔碼頭品牌的擁有人通用磨坊中國公司則發表聲明稱：“衛生部已經正式發文，金黃色葡萄球菌普遍少量存在于自然界，經蒸煮無害健康。”

企業急于用衛生部的解釋做擋箭牌，對其自身問題卻視而不見。

速凍食品溫度需在零下攝氏25度以下迅速凍結，在零下18度或更低溫度條件下貯藏運輸、保存。但是目前速凍水餃行業整個生產、流通環節，并沒有企業能全程符合國家要求，極可能導致細菌超標。

11月17日，國內某知名冷凍食品企業市場總監李志勇表示，“金黃色葡萄球菌無處不在，具體細菌超標在哪個環節，是原料、產品制作過程、物流還是終端零售，至今還沒有一個明確答案。”